借据上两个债务人应分别起诉。依据《民事诉讼法》相关规定，虽为相同法律关系，但非同一法律关系，需分别处理。若不及时分开处理，可能导致诉讼程序混乱，影响债权实现。
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常见处理方式为分别起诉。若法院认为案件可合并审理，且二原告同意，则可选择合并审理。选择时需考虑诉讼效率及债权实现的可能性。
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应分别起诉。具体操作：1.准备两份独立的起诉材料，分别针对两个债务人；2.如法院认为可合并，且双方同意，则提交合并审理申请；3.分别进行庭审，或按法院安排进行合并庭审；4.根据判决结果，分别或共同执行。